Revolution

Todo parecía en calma, hasta la aparición del llamado High Evolutionary, el cual quería eliminar a todos los mutantes de la tierra, a su vez, Mr. Siniester, pensaba en mutar a todos los habitantes de la tierra, fué muy díficil para los X-Men ganar esa batalla, pero al final salieron victoriosos.

Aquí, hay un salto de seis meses, donde Psylocke obtiene el poder de la telequinesis, y Jean los de telepatía, al parecer hubo un experimento por medio del cual se intercambiaron sus poderes, además vemos a una Shadowcat mas agresiva, Gambit lidereando el Clan de los ladrones, Rogue y Collosus en un acercamiento romántico, cambios de uniformes, cambios de alineaciones y nuevos integrantes.

Al iniciar, se tienen que enfrentar a los NEO, mutantes que dicen ser la siguiente generación de mutantes, más poderosos que los anteriores, los cuales buscan eliminar a los X-Men, ya que piensan que ellos son los causantes de que perdieran sus poderes seis meses atrás, lo cual causó la muerte de muchos NEO.

A duras penas logran sobrevivir, los Neo son llevados a Genosha por Magento, Pero quedaba una batalla por ganar, el Legacy Virus, el virus que el clon de Cable de nombre Stryfe liberó, esto sucedió hace tiempo en la saga "X-Cutioner´s Song". Al fin los X-Men Logran encontrar el método para eliminar el virus.

Se salvaron muchas vidas, pero el costo que se pago por ese logro fué muy alto, se perdió la vida de la doctora Moira McTagger y Otro X-Man, otro de los pilares del equipo, se perdió la vida de de Colossus... Quien se suicidó para poder obtener una cura de este virus

Dos pérdidas de las cuales los X-Men no se han podido recuperar, a Xavier le afecta específicamente la muerte de Moira, a tal grado que estuvo a punto de morir con ella, de no haber sido por la Ayuda de Cable y Jean Grey, Pero debido a este descuido se pierde otra vida...

La vida que se perdió es una que mucho tiempo atrás se salvó, el evento que años atrás se trató de evitar finalmente sucedió, el evento el cual Wolverine, Shadowcat, Rachel Summers, Magneto, Storm y otros mutantes del futuro trataron de evitar, ese evento visto en la Saga "Days From Future Past", al fin sucedió, todos los esfuerzos de los X-Men por evitarlo fracasaron, estoy hablando de la muerte del Senador Kelly.

De entre todas las derrotas y pérdidas, los X-Men obtienen una victoria, el regreso de Cyclops, desafortunadamente volvió justo a tiempo para un enfrentamiento con Magneto. Esa parte de la historia ha sido llamada "Eve of Destruction". En esta ocasión magneto caasi logra la victoria, de no haber sido por un grupo de X-Men sustitutos reunidos por Jean Grey y por Wolverine quien logra detenerlo al encajar sus garras en la espina dorsal de Magneto, dejándolo inválido.

Al final de esta batalla los X-Men replantean sus métodos, Xavier adopta una posición más agresiva con respecto a los problemas, un grupo de X-Men se separa, Cyclops cambia su carácter, la relación con Jean Se enfría, mientras Wolverine se siente más atraído a ella y ella a él.

Ahora los X-Men se encuentran divididos, existen tres grupos de mutantes, New X-Men, Uncanny X-Men y X-Treme X-Men.